Podstrona: Publikacje / Wizytówka pracownika PRz

2023

99. J. Nizioł, K. Ossoliński, A. Płaza-Altamer, A. Kołodziej, A. Nieczaj, T. Ruman, Analiza metabolomiczna surowicy krwi w poszukiwaniu biomarkerów raka pęcherza moczowego, Nauka i Przemysł, metody spektroskopowe w praktyce, nowe wyzwania i możliwości, Wydawnictwo Uniwersytetu Marii Curie-Skłodowskiej, 127, 2023 (publikacja recenzowana pokonferencyjna)

98. Nizioł, J., Ossoliński, K., Płaza-Altamer, A., Kołodziej, A., Ossolińska, A., Ossoliński, T., Nieczaj, A., Ruman, T.,
Untargeted urinary metabolomics for bladder cancer biomarker screening with ultrahigh-resolution mass spectrometry Scientific Reports (2023) 13 (1), art. no. 9802, DOI: 10.1038/s41598-023-36874-y

97. Ossoliński, K., Ruman, T., Copié, V., Tripet, B.P., Kołodziej, A., Płaza-Altamer, A., Ossolińska, A., Ossoliński, T., Nieczaj, A., Nizioł, J. Targeted and untargeted urinary metabolic profiling of bladder cancer,  J. Pharm. Biomed. Anal. (2023) 233, art. no. 115473, DOI: 10.1016/j.jpba.2023.115473

96. Szulc, J., Nizioł, J., Ruman, T., Kuźniar, A., Nowak, A., Okrasa, M., Nowak, I., Szponar, B., Kuberski, S., Biological and chemical contamination of illegal, uncontrolled refuse storage areas in Poland, Environmental Research,
(2023) 228, art. no. 115825, DOI: 10.1016/j.envres.2023.115825

95. Komar, M., Nowicka-Krawczyk, P., Ruman, T., Nizioł, J., Dudek, M., Gutarowska, B., Biodeterioration potential of algae on building materials - Model study, International Biodeterioration & Biodegradation (2023) 180, art. no. 105593, . DOI: 10.1016/j.ibiod.2023.105593

94. Ossoliński, K., Ruman, T., Ossoliński, T., Ossolińska, A., Arendowski, A., Kołodziej, A., Płaza-Altamer, A., Nizioł, J., Monoisotopic silver nanoparticles-based mass spectrometry imaging of human bladder cancer tissue: Biomarker discovery,  Adv. Med. Sci. (2023) 68 (1), pp. 38-45. DOI: 10.1016/j.advms.2022.12.002

92. K. Ossoliński, T. Ruman, V. Copié, B.P. Tripet, L. B. Nogueira, K.O.P.C. Nogueira, A. Kołodziej, A. Płaza-Altamer, A. Ossolińska, T. Ossoliński, J. Nizioł, Metabolomic and elemental profiling of blood serum in bladder cancer, Journal of Pharmaceutical Analysis, 2022, https://doi.org/10.1016/j.jpha.2022.08.004, IF = 14.026

91. J. Nizioł, K. Ossoliński, A. Płaza-Altamer, A. Kołodziej, A. Ossolińska, T. Ossoliński, T. Ruman, Untargeted ultra-high-resolution mass spectrometry metabolomic profiling of blood serum in bladder cancer  Scientific Reports volume 12, Article number: 15156 (2022)

90. Szulc, J., Okrasa, M., Nowak, A., Nizioł, J., Ruman, T., Kuberski, S., Assessment of Physicochemical, Microbiological and Toxicological Hazards at an Illegal Landfill in Central Poland, Int. J. Environ. Res. Public Health (2022) 19 (8), art. no. 4826, DOI: 10.3390/ijerph19084826

89. Kołodziej, A., Płaza-Altamer, A., Nizioł, J., Ruman, T. Infrared pulsed fiber laser-produced silver-109-nanoparticles for laser desorption/ionization mass spectrometry of carboxylic acids, International Journal of Mass Spectrometry (2022) 474, art. no. 116816, DOI: 10.1016/j.ijms.2022.116816

88. Komar, M., Nowicka-Krawczyk, P., Ruman, T., Nizioł, J., Konca, P., Gutarowska, B.
Metabolomic analysis of photosynthetic biofilms on building façades in temperate climate zones, (2022) International Biodeterioration & Biodegradation 169, art. no. 105374, DOI: 10.1016/j.ibiod.2022.105374

87. Płaza-Altamer, A., Kołodziej, A., Nizioł, J., Ruman, T. Infrared pulsed fiber laser-produced silver-109-nanoparticles for laser desorption/ionization mass spectrometry of amino acids, Journal of Mass Spectrometry (2022) 57 (3), art. no. e4815, DOI: 10.1002/jms.4815

86. Aneta Płaza, Artur Kołodziej, Joanna Nizioł and Tomasz Ruman, Laser Ablation Synthesis in Solution and Nebulization of Silver-109 Nanoparticles for Mass Spectrometry and Mass Spectrometry Imaging, ACS Measurement Science Au  2022, 2, 1, 14-22

85. Płaza-Altamer, A., Kołodziej, A., Nizioł, J., Ruman, T. Laser generated gold nanoparticles for mass spectrometry of low molecular weight compounds, Chemical Technology and Biotechnology, 2022, 61-69, e-ISSN 2720-6793

2020
78. Szulc, J., Ruman, T., Laser Ablation Remote-Electrospray Ionisation Mass Spectrometry (LARESI MSI) Imaging-New Method for Detection and Spatial Localization of Metabolites and Mycotoxins Produced by Moulds (2020) Toxins, 12 (11).


77. Kołodziej, A., Ruman, T., Nizioł, J., Gold and silver nanoparticles-based laser desorption/ionization mass spectrometry method for detection and quantification of carboxylic acids, (2020) Journal of Mass Spectrometry, 55 (10), art. no. e4604.


76. Arendowski, A., Ossoliński, K., Nizioł, J., Ruman, T., Gold nanostructures - assisted laser desorption/ionization mass spectrometry for kidney cancer blood serum biomarker screening, (2020) International Journal of Mass Spectrometry, 456, art. no. 116396.


75. Szulc, J., Ruman, T., Karbowska-Berent, J., Kozielec, T., Gutarowska, B., Analyses of microorganisms and metabolites diversity on historic photographs using innovative methods, (2020) Journal of Cultural Heritage, 45, pp. 101-113.


74. Nizioł, J., Ossoliński, K., Tripet, B.P., Copié, V., Arendowski, A., Ruman, T., Nuclear magnetic resonance and surface-assisted laser desorption/ionization mass spectrometry-based serum metabolomics of kidney cancer, (2020) Analytical and Bioanalytical Chemistry, 412 (23), pp. 5827-5841.


73. Szulc, J., Jablonskaja, I., Jabłońska, E., Ruman, T., Karbowska-Berent, J., Gutarowska, B., Metabolomics and metagenomics characteristic of historic beeswax seals, (2020) International Biodeterioration and Biodegradation, 152, art. no. 105012, .


72. Nizioł, J., Sunner, J., Beech, I., Ossoliński, K., Ossolińska, A., Ossoliński, T., Płaza, A., Ruman, T., Localization of Metabolites of Human Kidney Tissue with Infrared Laser-Based Selected Reaction Monitoring Mass Spectrometry Imaging and Silver-109 Nanoparticle-Based Surface Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry Imaging, (2020) Analytical Chemistry, 92 (6), pp. 4251-4258.


71. Szulc, J., Machnowski, W., Kowalska, S., Jachowicz, A., Ruman, T., Steglińska, A., Gutarowska, B. Beeswax-modified textiles: Method of preparation and assessment of antimicrobial properties, (2020) Polymers, 12 (2), art. no. 344.


70. Arendowski, A., Ossoliński, K., Nizioł, J., Ruman, T., Screening of Urinary Renal Cancer Metabolic Biomarkers with Gold Nanoparticles-assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry, (2020) Analytical Sciences, 36 (12), pp. 1521-1527.

2019:

69. K. Szmuc, M. Kus-Liskiewicz, Ł. Szyller , D. Szmuc, M. Stompor, I. Zawlik, T. Ruman, S. Wołowiec, J. Cebulski, Silver nanoparticles deposited on calcium hydrogenphosphate – silver phosphate matrix; biological activity of the composite,  Polish Journal of Chemical Technology, 2019, 21, 6-13.

68. K. Ossoliński, A. Ossolińska, T. Ossoliński, A. Arendowski, P. Wiechno, J. Kucharz, T. Ruman, J. Nizioł, Mass spectrometry-based metabolomic profiling of prostate cancer – a pilot study, special issue: "Discovery of biomarkers, precision medicine and immune oncology", J Cancer Metastasis Treat 2019, 5, 1.

67. M. Misiorek, J. Niziol, T. Ruman, Mass spectrometry imaging of low molecular weight metabolites in strawberry fruit (Fragaria x ananassa Duch.) cv. Primoris with 109Ag nanoparticle enhanced target, Phytochemistry, 2019, 159, 11-19, IF = 3.2

2018:

66. A. Arendowski, T. Ruman, Lysine detection and quantification by laser desorption/ionization mass spectrometry on gold nanoparticle-enhanced target, Anal. Methods, 2018,10, 5398-5405, IF = 2.1

65. J. Nizioł, V. Bonifay, K. Ossoliński, T. Ossoliński, A. Ossolińska, J. Sunner, I. Beech, A. Arendowski and T. Ruman, Metabolomic study of human tissue and urine in clear cell renal carcinoma by LC-HRMS and PLS-DA, Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2018, 410(16), 3859–3869, IF = 3.4

64. A. Arendowski, J. Szulc, J. Nizioł, B. Gutarowska and T. Ruman, Metabolic profiling of moulds with laser desorption/ionization mass spectrometry on gold nanoparticle enhanced target, Analytical Biochemistry, 2018, 549, 45-52, IF 2.3

63. J. Szulc, A. Otlewska, T. Ruman, K. Kubiak, J. Karbowska-Berent, T. Kozielec, B. Gutarowska, Analysis of paper foxing by newly available omics techniques, International Biodeterioration & Biodegradation, 2018, 132, 157-165, IF 3.2

62. A. Arendowski, J. Nizioł and T. Ruman, Silver-109-based laser desorption/ionization mass spectrometry method for detection and quantification of amino acids,  J Mass Spectrom. 2018; 53, 369–378, IF = 2.4 

61. A. Arendowski, J. Nizioł, K. Ossoliński, A. Ossolińska, T. Ossoliński, Z. Dobrowolski, T. Ruman, Laser desorption/ionization mass spectrometry imaging of cancer kidney tissue on silver nanoparticle enhanced target, Bioanalysis, 2018, 10(2)  83-94, IF 2.7.

2017:

60. Ł. Uram, J. Nizioł, P. Maj, J Sobich, W. Rode, T. Ruman, N(4)-[B-(4,4,5,5-tetramethyl-1,3,2-dioxaborolan)methyl]-2′-deoxycytidine as a potential boron delivery agent with respect to glioblastoma, Biomedicine & Pharmacotherapy, 2017, 95, 749-755, IF=2.8

59. J. Szulc, T. Ruman, B. Gutarowska, Metabolome profiles of moulds on carton-gypsum board and malt extract agar medium obtained using an AuNPET SALDI-ToF-MS method. International Biodeterioration & Biodegradation, 2017, 125, 13-23, IF(5Y) = 3.2

58. M. Misiorek, J. Sekuła and T. Ruman, Mass spectrometry imaging of low molecular weight compounds in garlic (Allium sativum L.) with gold nanoparticle enhanced target, Phytochemical Analysis, 2017, 28, 479-486. IF=2.5

57. J. Nizioł, J. Sekuła, T. Ruman, "Visualizing spatial distribution of small molecules in the rhubarb stalk (Rheum rhabarbarum) by surface-transfer mass spectrometry imaging", Phytochemistry, 2017, 139, 72-80, IF = 3.2. (publication featured on the cover).

56. A. Arendowski and T. Ruman, Laser desorption/ionization mass spectrometry imaging of European yew (Taxus baccata) on gold-nanoparticle enhanced target", Phytochemical Analysis, 2017, 28,  448-453, IF=2,5

2016:
55. Barbara Laskowska, Marek Laskowski, Anna Lewandowska, Tomasz Ruman, Zasady Schiffa oparte o związki dendrymeryczne oraz ich zastosowanie. Wydawnictwo Naukowe TYGIEL (4 pkt MNiSW), 2016.
54. Pietrzak K., Glińska S., Gapińska M., Ruman T., Nowak A., Aydın E., Gutarowska B. Silver nanoparticles: mechanism of action on moulds. Metallomics, 2016, 8, 1294, IF=3,6
53. J. Sekuła, J. Nizioł, T. Ruman, Zastosowanie nanocząstek srebra w laserowej spektrometrii mas oraz w obrazowaniu MS,  Wiadomości Chemiczne, zeszyt: 7-8-2016.
52. J. Nizioł, K. Ossoliński, T. Ossoliński, A. Ossolińska, V. Bonifay, J. Sekuła, Z. Dobrowolski, J. Sunner, I. Beech and T. Ruman, Surface-transfer mass spectrometry imaging of renal tissue on gold nano-particle enhanced target, Analytical Chemistry, 2016, 88 (14), pp 7365–7371 (IF = 5.9).
51. Jan Ludwiczak, Piotr Maj, Piotr Wilk, Tomasz Frączyk,Tomasz Ruman, Borys Kierdaszuk, Adam Jarmuła and Wojciech Rode, Phosphorylation of thymidylate synthase affects slow-binding inhibition by 5-fluorodUMP and N4-hydroxy-dCMP, Molecular BioSystems, 2016, Mol. BioSyst., 2016,12, 1333-1341, IF = 3.21
 
2015:
50. J. Sekuła, J. Nizioł, M. Misiorek, P. Dec, A. Wrona, A. Arendowski and T, Ruman, Gold nanoparticle-enhanced target for MS analysis and imaging of harmful compounds in plant, animal tissue and on fingerprint, Analytica Chimica Acta, 2015, 895, 45-53, IF = 4.7.
49. J. Nizioł, Ł. Uram, M. Szuster, J. Sekuła and T. Ruman, Biological activity of N(4)-boronated derivatives of 2’-deoxycytidine, potential agents for boron-neutron capture therapy, Bioorg. Med. Chem. (2015), 23 (2015), pp. 6297-6304, IF (5y) = 2.97
48. T. Frączyk, T. Ruman, P. Wilk, P. Palmowski, A. Rogowska-Wrzesińska, J. Cieśla, Z. Zieliński, J. Nizioł, A. Jarmuła, P. Maj, B. Gołos, P. Wińska, S. Ostafil, E. Wałajtys-Rode, D. Shugar, W. Rode, Properties of Phosphorylated Thymidylate Synthase, BBA - Proteins and Proteomics, 2015, 1854, 1922-1934. IF (5-year) = 3.127;
47. J. Sekuła, J. Nizioł, W. Rode and T. Ruman, Silver nanostructures in laser desorption/ionization mass spectrometry and mass spectrometry imaging. Review article, Analyst, 2015, w druku, IF = 4.1. Analyst, 2015, 140, 6195 - 6209
46. J. Nizioł, W. Rode and T. Ruman, The investigation of borane-unsaturated nucleoside reaction system. Organic Communications, (2015), 8:1; 9-16
45. J. Sekuła, J. Nizioł, W. Rode and T. Ruman, “Gold nanoparticle-enhanced target (AuNPET) as universal solution for laser desorption/ionization mass spectrometry analysis and imaging of low molecular weight compounds”, Analytica Chimica Acta 875, 2015, 61–72. IF = 4,7 (5-letni).
 
2014:
44. J. Nizioł, Z. Zieliński, P. Maj, W. Rode and T. Ruman, N(4)-boronated derivatives of 2’-deoxycytidine as potential BNCT agents, Anticancer Research 2014, 34, 6143-6145. (publikacja pokonferencyjna recenzowana).
43. J. Nizioł,  Z. Zieliński, A. Leś, M. Dąbrowska, W. Rode and T. Ruman, Synthesis, reactivity and biological activity of N(4)-boronated derivatives of 2'-deoxycytidine, Bioorg. Med. Chem. (2014), 22,  3906-3912, IF(5y) = 3.15
42. Piotr Wilk, Adam Jarmuła, Tomasz Ruman Katarzyna Banaszak, Wojciech Rypniewski, Joanna Cieśla, Anna Dowierciał, Wojciech Rode, Crystal structure of phosphoramide-phosphorylated thymidylate synthase reveals pSer127, reflecting probably pHis to pSer phosphotransfer, Bioorganic Chemistry, 52 (2014) 44–49.
 
2013:
41. J. Nizioł and T. Ruman, Surface-transfer mass spectrometry imaging on monoisotopic silver nanoparticle enhanced target, Anal. Chem., 2013, 85 (24), pp 12070–12076,  IF=5.9
40. J. Nizioł and T. Ruman, The synthesis and NMR properties of boron analogues of nucleotides and cyclic nucleotides, Letters in Organic Chemistry, 2013, 10, 664-667
39. Joanna Nizioł and Tomasz Ruman, Silver 109Ag nanoparticles for matrix-less mass spectrometry of nucleosides and nucleic bases,  International Journal of Chemical Engineering and Applications, 2013, vol. 2(4), p. 46-49
38. J. Nizioł, W. Rode, B. Laskowska and T. Ruman, Novel monoisotopic 109AgNPET for laser desorption-ionization mass spectrometry, Anal. Chem. 2013, 85(3), p.1926-1931, IF=5.9
37. J. Nizioł, Z. Zieliński, W. Rode and T. Ruman, Matrix-free laser desorption-ionization with silver nanoparticle enhanced steel targets, Int. J. Mass Spectrom., 2013, 335, 22-32
 
2012:
36. J. Nizioł, W. Rode and T. Ruman. Boron nucleic acid bases, nucleosides and nucleotides. Mini-Reviews In Organic Chemistry, 2012, 9(4), 418-425
35. J. Nizioł and T. Ruman, Exceptionally selective catalytic hydrogenation of alkene with pinacolborane, Letters in Organic Chemistry Vol. 9, No. 4, 257-262, 2012
34. E. Dąbrowska-Maś, T. Frączyk, T. Ruman, K. Kowalewska, P. Wilk, J. Ciela, Z. Zieliński, A. Jurkiewicz, B. Gołos, P. Wińska, E. Wałajtys-Rode, A. Leś, J. Nizioł, A. Jarmuła, P. Stefanowicz, Z. Szewczuk, W. Rode , Tyrosine nitration affects thymidylate synthase properties, Org. Biomol. Chem., 2012, 10, 323–331
 
2011:
33. J. Kisala, T. Ruman, Pincer complexes based on phosphinoaminopyridines: synthesis, structural characterization and catalytic applications; Current Organic Chemistry, 2011, 15 3486-3502.
 
2010:
32. T. Frączyk, T. Ruman, D. Rut, E. Dąbrowska-Maś, J. Cieśla, Z. Zieliński, K. Sieczka, J. Dębski, B. Gołos, P. Wińska, E. Wałajtys-Rode, D. Shugar, W. Rode, Histidine phosphorylation, or tyrosine nitration, Affects Thymidylate Synthase Properties, Pteridines 20: 137-142, 2010
31. K. Długopolska, J. Kisała, M. Danilczuk, D. Pogocki, T. Ruman. The Analysis of Hyperfine Shifts of Monoligand High-spin Cobalt(II) Pyrazolylborate Complexes. Applied Magnetic Resonance 2010, 38(3), 321-335
30. Tomasz Ruman, Karolina Długopolska and Wojciech Rode, Synthesis and NMR properties of the first boron analogues of uracil, Bioorganic Chemistry 38 (2010) 33–36
29. Tomasz Ruman, Karolina Długopolska, Agata Jurkiewicz, Katarzyna Rydel, Andrzej Leś and Wojciech Rode, "The synthesis and NMR investigation on novel boron derivatives of stavudine", Bioorganic Chemistry (2010), 38(3), p. 87-91
28. Tomasz Ruman, Karolina Długopolska, Agata Jurkiewicz, Dagmara Kramarz, Tomasz Frączyk, Joanna Cieśla, Andrzej Leś, Zbigniew Szewczuk and Wojciech Rode, "Thiophosphorylation of free amino acids and enzyme protein by thiophosphoramidate ions", Bioorganic Chemistry, 2010, vol 38(2), p. 74-80.
27. K. Kowalewska, P. Stefanowicz, T. Ruman, T. Frączyk, W. Rode and Z. Szewczuk, "Electron Capture Dissociation Mass Spectrometric Analysis of Lysine-Phosphorylated Peptides", Biosci. Rep. 2010, 30, 433–443
26. T. Ruman, A. Jarmuła and W. Rode, The aromaticity of 5,6-dihydroborauracil, borauracil and benzoborauracil systems,  Bioorganic Chemistry, 2010, 38, 242-245
 
2009:
25. T. Frączyk, T. Ruman, D. Rut, E. Dąbrowska-Maś, J. Cieśla, Z. Zieliński, K. Sieczka, J. Dębski, B. Gołos, P. Wińska, E. Wałajtys-Rode, D. Shugar, W. Rode, Histidine phosphorylation, or tyrosine nitration, Affects Thymidylate Synthase Properties, Pteridines 2009, 20, 79-80.
24. Tomasz Ruman, Karolina Długopolska, Anna Kuśnierz and Wojciech Rode, Synthesis and NMR properties of 5,6-dihydroborauracil and 5,6-dihydroborathymine, Bioorganic Chemistry, 2009, 37(5), 180-184
23. Tomasz Ruman, Karolina Długopolska, Dagmara Kramarz, Agata Jurkiewicz, Andrzej Leś, and Wojciech Rode, "The synthesis, reactivity and NMR investigation on 15N-thiophosphoramidates", Letters in Organic Chemistry, 2009, 8(6) 642-647.
22. Tomasz Ruman, Karolina Długopolska, Anna Kuśnierz, Agata Jurkiewicz, Andrzej Leś and Wojciech Rode, "Synthesis and NMR properties of novel 5,6-dihydroborauracil derivatives", Bioorganic Chemistry, 2009, 37(3), 65-69
21. K. Długopolska, T. Ruman, D. Pogocki, M. Danilczuk, „Medyczne zastosowania sit molekularnych”, Wiad. Chem., 2009, 63, 11-12
 
2008:
20. Altered properties of phosphorylated or nitrosylated thymidylate synthase. T. Frączyk, T. Ruman, D. Rut, E. Dąbrowska-Maś, J. Cieśla, Z. Zieliński, K. Sieczka, J. Sikora, E. Wałajtys-Rode, D. Shugar, W. Rode, Anticancer Research, 2008, vol 28, p.3462-3463
19. Karolina Długopolska, Tomasz Ruman, Marek Danilczuk, Dariusz Pogocki. "The Analysis of Nuclear Magnetic Resonance Shifts of High-spin Cobalt(II) Complexes", Applied Magnetic Resonance, 2008 p.271-283, vol 35,  
18. Marek Danilczuk, Karolina Długopolska, Tomasz Ruman, and Dariusz Pogocki; "Molecular Sieves in Medicine" Mini-Reviews in Medicinal Chemistry, 2008 , 8, 1407-1417
 
2007:
17. Tomasz Ruman, Anna Kuśnierz, Agata Jurkiewicz, Andrzej Leś, and Wojciech Rode, The synthesis, reactivity and 1H NMR investigation of the hydroxyborohydride anion, Inorganic Chemistry Communications, 2007, 10, 1074-1078.
16. Dariusz Pogocki, Tomasz Ruman,Magdalena Danilczuk,Marek Danilczuk,Monika Celuch and Elżbieta Wałajtys-Rode, “Application of Nicotine Enantiomers, Close Derivatives and Analogues in Therapy of Neurodegenerative Disorders”, European Journal of Pharmacology, 2007, 563(1-3), 18-39 (review article).


Publikacje przed doktoratem

15. T. Ruman, Z. Ciunik, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate ligands. Part XII. Variable hapticity of hydrobis(3-phenyl-5-isopropylpyrazolyl)(3,5-dimethylpyrazolyl)borate in its rhodium(I) complexes with COD and NBD”
Polyhedron, 23/2-3 (2004) 219-223
 
14. Z. Ciunik, T. Ruman, M. Łukasiewicz, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate ligands. Part XI. Weak CH/p interactions in crystals of hydrotris(3-phenylpyrazolyl)boratothallium(I) and hydrobis(5-methyl-3-phenylpyrazolyl)(3,5-dimethylpyrazol-yl)boratothallium(I) studied by X-ray crystallography”
J. Mol. Struct., 690/1-3 (2004).
 
13. T. Ruman, Z. Ciunik, S. Wołowiec, „ Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands. Part VIII. Synthesis, X-ray crystallographic and 1H NMR structural studies on cobalt(II) complexes of homoscorpionate, heteroscorpionates and chiral trispyrazolylborates obtained from 3(5)-phenyl-5(3)-iso-propylpyrazole and 3,5-dimethylpyrazole”
Eur. J. Inorg. Chem. (2003) 2475-2485.
 
12. J. Kisała, Z. Ciunik, K. Drabent, T. Ruman, S. Wołowiec, “The complexes of tetra(3-isopropylpyrazolyl)borate anionic ligand with cobalt(II), nickel(II) and copper(II)” Polyhedron 22 (2003) 1645-1652.
 
11. T. Ruman, Z. Ciunik, A. M. Trzeciak S. Wołowiec, J. J. Ziółkowski, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands. Part X.
Structures and Fluxional Behavior of Rhodium(I) Complexes with Heteroscorpionate Trispyrazolylborate Ligands, Tp”Rh(LL); (LL) = (CO)2 or (COD)’
Organometallics, 22 (2003) 1072-1080.
 
10. T. Ruman, Z. Ciunik, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate ligands. Part IX. X-ray crystallographic studies on cobalt(II) complexes of hydrobis(3-phenyl,5-methylpyrazolyl)(3,5-diethylpyrazolyl)borate” Polyhedron 22 (2003) 581-586.
 
9. T. Ruman, Z. Ciunik, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands. Part VII.
The bonding ambivalency of 3(5)-iso-propylpyrazolyl moiety in homo- and heteroscorpionate hydrobis(n-iso-propylpyrazolyl)(3-R1-5-R2-pyrazolyl)boratocobalt(II) complexes. Eur. J. Inorg. Chem. (2003) 89-93.
 
8. T. Ruman, Z. Ciunik, E. Szklanny, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands. Part VI.
Carboxylate induced conversion of mono-ligand Tp’M(L) into bis-ligand Tp’2M complexes (M = Co(II) and Cu(II)). Polyhedron 21 (2002) 2743-2753.
 
7. T. Ruman, Z. Ciunik,  A. Goclan, M. Łukasiewicz, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands. Part V. X-ray crystallographic studies of cobalt(II) complexes with hydrobis(3,5-dimethylpyrazolyl)(3,5-diphenylpyrazolyl)borate and hydrobis(3,5-diphenylpyrazolyl)(3,5-dimethylpyrazolyl)borate ligands.” Polyhedron 20 (2001) 2965-2970.
 
6. T. Ruman, Z. Ciunik, J. Mazurek, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands.
Part IV. Poly(pyrazolyl)borate anionic ligands obtained from 3,5-di-methylpyrazole and 3,5-diphenylpyrazole and their cobalt(II) complexes.”
Eur. J. Inorg. Chem. (2002) 754-760.

5. T. Ruman, M. Łukasiewicz, Z. Ciunik, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands.
Part III. X-ray crystallographic and NMR studies on cobalt(II) complexes with tris(pyrazolyl)borate anionic ligands obtained from 3,5-di-methylpyrazole and 3(5)-methyl,5(3)-phenylpyrazole. Polyhedron 20 (2001) 2551-2558.
4. M. Łukasiewicz, Z. Ciunik, T. Ruman, M. Skóra, S. Wołowiec, “Complexes of heteroscorpionate trispyrazolylborate anionic ligands.
Part II. The X-ray crystallographic and 1H NMR studies on thiocyanato[hydrobis(3-phenylpyrazolyl)(3,5-di-tert-butylpyrazolyl)borato]cobalt(II) and thiocyanato[hydrobis(3-phenyl,5-methylpyrazolyl)(3-methyl,5-phenylylpyrazol-yl)borato]cobalt(II) complexes.” Polyhedron 20 (2001) 237-244.

3. I. Zarzyka-Niemiec, J. Lubczak, Z. Ciunik, S. Wołowiec, T. Ruman, „Hydroxyalkylated derivatives of parabanic acid”. Heterocyclic. Commun, 8 (2002) 559-563.

2. T. Ruman, „Od genu do lekarstwa. Nowe metody badawcze”. Gazeta Politechniki, 10/2002, p.10, Politechnika Rzeszowska. (paper in polish)

1. J. Kalembkiewicz, T. Ruman, „Zastosowanie derywatyzacji w metodach chromatograficznych w analizie śladowej”. Wiadomości Chemiczne, 2004, 58, 263
----------------------------------------------------------------------------

Wybrane wystąpienia konferencyjne, seminaria, wykłady na zaproszenie / Conferences/seminars/invited lectures:
1. T. Ruman, Z. Ciunik, S. Wolowiec, "From homoscorpionates, through spontaneous heteroscorpionates, synthetic heteroscorpionates, to chiral scorpionates" 33rd Crystallographic course at the E. Majorana Centre: Erice, Italy, May 23 – June 2, 2002
2.  T. Ruman, S. Wolowiec, Z. Ciunik, „Trispyrazolylborates - tripodal ligands of tunable symmetry”. YoungChem 2003, Zakopane, 21-26th October 2003. Referat (w języku angielskim)
3. S. Wolowiec, Z. Ciunik, T. Ruman, "From homoscorpionates, through spontaneous heteroscorpionates, synthetic heteroscorpionates, to chiral scorpionates". 225th National Meeting of the American-Chemical-Society Location - ACS Meeting, 23-27 March, 2003, New Orleans, Symposium „Scorpionate Ligands Thirty-Five Years Later”. Invited Lecture 430.
4. T. Ruman, Z. Ciunik, S. Wołowiec, „Kompleksy kobaltu(II) z heteroskorpionianowymi ligandami trispirazoliloboranowymi”XLV Zjazd PTChem, Kraków 9-12.09.2002, Materiały Zjazdowe, tom I, str. 316
5. Indukowana rodnikami sulfanylowymi racemizacja alkaloidów. D. Pogocki, A. Bielecka, M. Celuch, M. Krupa, J. Pióro, T. Ruman, Sesja sprawozdawcza użytkowników Komputerów Dużej Mocy (KDM) Interdyscyplinarnego Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego Uniwersytetu Warszawskiego, Jadwisin, 8-11.03.2006.
6. Kataliza nukleofilowa procesów jednolektronowego utleniania tioeterów organicznych. D. Pogocki, M. Celuch, M. Enache, T. Ruman, Sesja sprawozdawcza użytkowników Komputerów Dużej Mocy (KDM) Interdyscyplinarnego Centrum Modelowania Matematycznego i Komputerowego Uniwersytetu Warszawskiego, Jadwisin, 8-11.03.2006.
7. Stereoelectronic control over the mechanism of one-electron oxidation-induced fragmentation of substituted thioethers. M. Celuch, M. Enache, T. Ruman, D. Pogocki, 3rd European Young Investigator Conference - EYIC 2007 June 13-17, 2007, Collegium Polonicum, Slubice ().
8. Free radicals induced racemization of nictotine receptor agonists. D. Pogocki, A. Bielecka, M. Celuch, M. Krupa, J. Pióro, T. Ruman, 3rd European Young Investigator Conference - EYIC 2007 June 13-17, 2007, Collegium Polonicum, Slubice ().
9. Altered properties of phosphorylated or nitrosylated thymidylate synthase. T. Frączyk, T. Ruman, D. Rut, E. Dąbrowska-Maś, J. Cieśla, Z. Zieliński, K. Sieczka, J. Sikora, E. Wałajtys-Rode, D. Shugar, W. Rode (Rzeszow;Warszawa, Poland) EIGHTH INTERNATIONAL CONFERENCE OF ANTICANCER RESEARCH, 2008, 566A, pages 3462-3463, October 17-22, Kos, Greece
10. D. Pogocki, J. Mirkowski, T. Ruman, K. Szpara, M. Celuch ‘Pulse radiolysis and DFT studies on the radical reaction of nicotine’, 8th International Conference on Pulse Investigation in Chemistry, 6-12/09/2008, Kraków, Polska.
11. Histidine Phosphorylation, or Tyrosine Nitration, Affects Thymidylate Synthase Properties Wojciech Rode, Tomasz Fraczyk, Tomasz Ruman Dagmara Kramarz, Elzbieta Dabrowska, Joanna Ciesla, Zbigniew Zielinski, Katarzyna Rys, Jacek Sikora, Barbara Golos, Patrycja Winska, Elzbieta Walajtys-Rode, David Shugar. 14th International Symposium on Pteridines and Folates Held in Hyatt Regency Jeju, June 7~12, 2009
12. Histidine phosphorylation afects thymidylate synthase properties, Tomasz Frączyk, Tomasz Ruman, Joanna Cieśla, Zbigniew Zieliński, Elżbieta Wałajtys-Rode and Wojciech Rode, 6th International Conference:  Inhibitors  of Protein Kinases, June 27 - July 1, 2009, Warsaw, Poland
13. Karolina Długopolska, Tomasz Ruman, Anna Kuśnierz, Agata Jurkiewicz, Andrzej Leś and Wojciech Rode, Synteza i właściwości NMR pochodnych 5,6-dihydroborauracyli. 52 Zjazd PTCh i SITPChem. Łódź, 12-16 września 2009, PC-02-08, B034
14. Frączyk T, Ruman T, Cieśla J, Zielinski Z, Wałajtys-Rode E, Rode W (2009) Histidine phosphorylation affects thymidylate synthase properties. Acta Biochim Pol 56 (S1) 42-43
15. Joanna Niziol and Tomasz Ruman, Catalytic hydrogenation and hydroboration of model and biologically active (nucleoside) alkene with borane. 243rd ACS National Meeting & Exposition, March 25-29 2012, San Diego, California, USA, no. 792.
16. IVth International Mini-Symposium ‘Boron-organic compounds in modern organic synthesis and practical applications’. Wydział Chemii Uniwersytetu Łódzkiego, 24-25 May 2012. Invited speaker, wyklad pt. "Catalytic hydrogenation and hydroboration of model cycloalkene", Joanna Nizioł and Tomasz Ruman.
17. 3rd International Conference on Chemistry and Chemical Process (ICCCP 2013), Beijing, China, 21-22 April 2013, "Nanoparticle-based laser mass spectrometry methods", T. Ruman and J. Nizioł; T. Ruman as invited keynote speaker and session chairman
18. A. Arendowski, T. Ruman, Obrazowanie MS substancji małocząsteczkowych w tkankach, IV Międzyuczelniane Sympozjum Biotechnologiczne SYMBIOZA, Warszawa 29-31 maja 2015, P7
19. B. Laskowska, T. Ruman, Konferencja pt. "Wpływ Młodych Naukowców na osiągnięcia Polskiej Nauki". Edycja VII. Kraków 6.12.2014 - Nowe trendy w naukach przyrodniczych; Tytuł wystąpienia: Synteza i badania dendrymerów typu PAMAM jako nośników substancji o znaczeniu biologicznym.
20. B. Laskowska, T. Ruman, III Łódzkie Sympozjum Doktorantów Chemii. Łódź, 27-28.04.2015. Tytuł wystąpienia: Synteza i badania zasad Schiffa z cząsteczkami dendrymerycznymi jako związków o znaczeniu biologicznym.
21. 8 Kongres Technologii Chemicznej, Rzeszów, 30 sierpnia- 4 września 2015, Nanocząstki metaliczne w analizie i obrazowaniu MS, Justyna Sekuła, Tomasz Ruman, S4-P52
22. J. Nizioł, Ł. Uram, M. Szuster, Z. Zieliński, P. Maj, W. Rode, T. Ruman; "Boron compounds for BNCT", Congress of the 50 years of Polish Society of Medical Physics (PTFM), Warsaw, 3-5.9.2015, TR as invited speaker (session in english).
23. Seminarium "Research activities of T. Ruman's group". The University of Oklahoma, OK, USA, Department of Microbiology and Plant Biology, 11.2.2016.
24. Wykład "Boron compounds in medicine" Erasmus+, Staff mobility for teaching between Programme Countries, Norway, University of Stavanger, Faculty of Science and Technology, 4.4.2016.
25. Wykład "Nanoparticles in mass spectrometry", Erasmus+, Staff mobility for teaching between Programme Countries, Norway, University of Stavanger, Faculty of Science and Technology, 7.4.2016.
26. Metabolomic Imaging of Biofilm and Other Biological Materials for Studying Metabolomic Heterogeneity; Tomasz Ruman; Joanna Nizioł; Vincent Bonifay; Jon Brauer; Christine Gaylarde; Iwona B Beech; Jan A Sunner. WP356 (poster), The 64th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, San Antonio, TX, USA.
27. Adrian Arendowski, Joanna Nizioł, Tomasz Ruman "Laser desorption/ionization mass spectrometry imaging and analysis in renal cell carcinoma biomarker discovery"; The 11 th International Conference of Young Naturalists 23-26 November 2016, Zielona Góra, Poland.
28. Seminarium „Wybrane problemy chemii”, 9-10 luty 2017 r, PRz, Wykład pt. „Czy analiza chemiczna może uratować życie?”. Seminarium organizowane przez Wydział Chemiczny Politechniki Rzeszowskiej, I Liceum Ogólnokształcące im. ks. St. Konarskiego w Rzeszowie oraz Rzeszowski Oddział Polskiego Towarzystwa Chemicznego.
29. B. Laskowska, M. Laskowski, T. Ruman, IX Interdyscyplinarna Konferencja Naukowa „Interdyscyplinarność kluczem do rozwoju” Zdolność polimerów dendrymerycznych do tworzenia kompleksów typu host-guest i ich biomedyczne zastosowanie. 18-19 marca 2017 Lublin.
30. B. Laskowska, M. Laskowski, T. Ruman, VIII Interdyscyplinarna Konferencja Naukowa. Interdyscyplinarność kluczem do rozwoju”.    Zasady Schiffa otrzymane z wykorzystaniem związków dendrymerycznych i ich zastosowanie, 12-13 marca 2016 Lublin.
31. B. Laskowska, M. Laskowski, T. Ruman, IV Międzynarodowa Konferencja Naukowo – Szkoleniowa „Interdyscyplinarne aspekty urody, zdrowia i choroby” Dendrimeric polymers as compounds of dermatological applications, 12–13 maja 2016 Jarosław.
32. Wykład pt. "Analiza chemiczna w badaniu dopalaczy", 9.5.2017, Sokołów, Seminarium dla uczniów gimnazjum pt. "Jestem świadomy - nie biorę" pod patronatem Burmistrza miasta Sokołów Młp.
33. Pietrzak K., Glińska S., Gapińska M., Ruman T., Nowak A., Aydin E., Gutarowska B. Silver nanoparticles mechanism of action on moulds’ ultrastructure and metabolome. III International Conference of Cell Biology "The versatility of cell biology research in life science". Kraków, Poland 26-27.05.2017, proceedings p. 81
34. Beata Gutarowska, Anna Otlewska, Justyna Szulc, Justyna Adamiak, Vincent Bonifay, Katarzyna Kubiak, Tomasz Ruman, Techniki -omics w diagnostyce biodeterioracji obiektów dziedzictwa kulturowego, Konferencja 90 lat Polskiego Towarzystwa Mikrobiologów, „PTM wczoraj – dziś – jutro”, 22-23.9.2017, Kraków.
35. Szulc J., Ruman T., Gutarowska B. (2017). AuNPET SALDI-ToF-MS – modern approach for analysis of metabolome profiles including secondary metabolites produced by moulds on building materials. 39th Mycotoxin Workshop,  June, 19th-21st 2017, Bydgoszcz. Materiały konferencyjne str. 120. (prezentacja posterowa)
36. Adamiak J., Szulc J., Otlewska A., Ruman T., Kubiak K., Gutarowska B. (2017). Metagenomika i metabolomika w diagnostyce foxingu. II Ogólnopolskie Sympozjum Mikrobiologiczne „Metagenomy Różnych Środowisk”, Lublin 29-30 czerwca 2017 r.  Materiały konferencyjne str. 27-28. (doniesienie ustne).

37. T. Ruman, “Nanoparticles for laser desorption/ionization mass spectrometry imaging of biological objects”, invited lecture (Erasmus+ project), UFOP, Ouro Preto, Brazil, 27.6.2017.
38.  Barbara Laskowska, Marek Laskowski, Tomasz Ruman, X Interdyscyplinarna Konferencja Naukowa TYGIEL 2018. Lublin, 17 - 18.03.2018. Temat: Polimery dendrymeryczne wykorzystywane do wykrywania i wychwytu metali oraz wybranych anionów, wystąpnienie ustne (B.L.) streszczenie str. 126 (książka abstraktów) 
39. Barbara Laskowska, Marek Laskowski, Anna Lewandowska, Tomasz Ruman, VI Międzynarodowa Konferencja Naukowa. Jarosław, 17.05.2018, Temat 1:  Polimery dendrymeryczne jako nanocząstki tworzące kompleksy typu host – guest.
40. Barbara Laskowska, Marek Laskowski, Anna Lewandowska, Tomasz Ruman, VI Międzynarodowa Konferencja Naukowa. Jarosław, 17.05.2018, Bezpieczeństwo mikrobiologiczne produktów leczniczych i kosmetyków.

41. Wykład popularnonaukowy: "Obrazowanie spektrometrią mas metodą przyszłości(?)", Jubileusz 50-lecia Wydziału Chemicznego Politechniki Rzeszowskiej, 23 czerwca 2018, Rzeszów.

42. Justyna Sekuła, Tomasz Ruman, Joanna Nizioł, Application of metallic nanoparticles in LDI MS and mass spectrometry imaging, European Chemistry Conference 2018, July 4-6, Rome, Italy, poster, P20.

43. T. Ruman, Nanoparticle-based laser desorption/ionization mass spectrometry in kidney cancer biomarker discovery. International Conference on Current Trends in Higher Education ICCTHE -ADAMAS 2019, 21-22 January 2019, Kolkata, India.

44. T. Ruman, "Research cooperation between RUT and UFOP: biomarker research and boron-neutron cancer therapy", Erasmus+ seminar, UFOP, Ouro Preto, Brazil, 7.2.2019.

45. T. Ruman, J. Szulc, "Mass spectrometry imaging in detection and localization of metabolites of moulds", 12th International Conference "Mycotoxins and moulds - current trends", Bydgoszcz, Poland, June 26-27, 2019 (T.R.-short lecture).

46. T. Ruman, Mass spectrometry imaging in detection and localization of metabolites / Obrazowanie spektrometrią mas w detekcji i lokalizacji metabolitów, wykład zaproszony/invited lecture, Jubileusz Polskiego Towarzystwa Spektrometrii Mas, 6 września 2019 Sesja Satelitarna - w czasie 62 Zjazdu Naukowego PTChem w Warszawie (PW).

47. T. Ruman, "Obrazowanie spektrometrią mas metodą przyszłości?" Wykład inauguracyjny, 69 rok akademicki PRz, Rzeszów, 11.10.2019. Eng.: "Mass spectrometry imaging - method of the future?" Inaugural lecture of the 69th academic year, PRz,  Rzeszów, 11/10/2019.

48. Rozdział w monografii: OBRAZOWANIE TKANEK ZA POMOCĄ SPEKTROMETRII MAS z LASEROWĄ DESORPCJĄ/JONIZACJĄ, J. NIZIOŁ, A. PŁAZA-ALTAMER, A. KOŁODZIEJ, T. RUMAN. NAUKA I PRZEMYSŁ
nowe wyzwania i możliwości, Uniwersytet Marii Curie-Skłodowskiej w Lublinie, Wydział Chemii
Praca zbiorowa pod redakcją prof. dr hab. Zbigniewa Hubickiego, Wydawnictwo UMCS, Lublin 2022
ISBN 978-83-227-9602-3